Dr.dr.Amalia Tri Utami,M.Biomed*
SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) adalah penyebab utama di balik pandemi penyakit coronavirus 2019 (COVID-19) saat ini. Protease utama SARS-CoV-2 memainkan peran dinamis dalam memediasi replikasi dan transkripsi virus, yang merupakan salah satu target obat yang paling mungkin melawan SARS-CoV-2.
Kandungan buah tin ini mencakup molekul bioaktif terkenal dengan berbagai sifat biologis, termasuk aktivitas antivirus. Dalam sebuah penelitian, senyawa dari buah tin disaring untuk mengetahui fitokimia aktif terhadap protease utama SARS-CoV-2 melalui docking molekuler, simulasi dinamika molekuler, dan profil ADMET (absorpsi, distribusi, metabolisme, ekskresi, dan toksisitas).
Sebanyak 21 senyawa disaring, dan senyawa, lupeol, -amyrin, dan luteolin, menunjukkan afinitas pengikatan tertinggi dan interaksi intens dengan residu katalitik vital His 41 dan Cys 145. Simulasi dinamika molekuler mengungkapkan bahwa amyrin adalah senyawa yang paling stabil dengan energi bebas ikatan yang lebih tinggi.
Menunjukkan bahwa senyawa ini dapat bersaing dengan ligan asli dari protease utama. Analisis ADMET menunjukkan bahwa fitokimia ini memiliki sifat fisikokimia, farmakokinetik, dan sifat mirip obat dan tidak memiliki efek merugikan yang berarti dan dapat dianggap sebagai kandidat obat potensial untuk melawan SARS-CoV-2. Namun, uji in-vitro, in-vivo, dan klinis lebih lanjut diperlukan untuk mengamati efisiensi yang tepat dari senyawa ini.
Buah tin adalah salah satu buah yang sangat spesial bagi umat Islam, hal ini dikarenakan buah tin, sangat jelas disebutkan dalam salah satu surah dalam Al-Qur’an, yakni surat At-Tiin. Berikut ini salah satu penggalan ayat dalam QS. At Tin :
وَالتِّينِ وَالزَّيْتُونِ
“Demi buah tin dan buah zaitun”
Buah tin termasuk dalam tanaman subtropis. Nama “Tin” berasal dari bahasa Arab. Tetapi, masyarakat umumnya mengenal dengan nama buah ara. Tanaman ini berasal dari Timur Tengah dan sudah tersebar hingga dataran Eropa, Amerika hingga Asia Tenggara, termasuk Indonesia.
Buah mudanya berwarna hijau dan akan matang seiring waktu. Buah tin yang matang memiliki warna kulit ungu kehitaman dan bagian dalamnya berwarna merah. Buah dari pohon Tin berbiji banyak, mengandung sedikit air, dan rasanya manis.
SARS-CoV-2 seperti mimpi buruk tak terduga tahun 2020 yang menghambat aktivitas normal manusia dan mengubah cara hidup di bumi. SARS-CoV-2 adalah virus beruntai tunggal, positif-sense, beramplop dengan genom RNA berukuran sekitar ~ 30kb. Sayangnya, tidak ada vaksin atau obat khusus yang tersedia untuk mengobati SARS-CoV-2, meskipun berbagai uji klinis mulai menguji kelayakan beberapa obat.
Sementara itu, beberapa obat yang ada digunakan kembali seperti remdesivir, chloroquine, hydroxychloroquine, lopinavir, dan ritonavir telah diguakan untuk melawan infeksi SARS-CoV-2. Namun, kemanjuran dan keamanannya masih dipertanyakan.
Enzim protease SARS-CoV-2 memotong polipeptida aslinya dan menghasilkan fragmen aktif yang bertanggung jawab untuk replikasi, transkripsi, dan translasi virus. Polipeptida ini penting untuk replikasi virus, transkripsi, dan translasi. Protease utama (M pro) mengkatalisis relevansi poliprotein translasi SARS-CoV-2 dengan siklus hidup virus dan membuatnya berfungsi.
Mpro memiliki tiga domain fungsional; domain I (residu 8-101), domain II (residu 102-184), dan domain III (residu 201-303) [12]. Domain II bergabung dengan domain III dengan loop (residu 185-200). Situs lampiran ligan terletak di loop domain I dan domain II di mana katalitik dyad Cys 145-His 41 memainkan peran penting dalam manajemen ligan.
Mpro juga memainkan peran penting dalam replikasi SARS-CoV-2. Selain itu, Mpro tidak secara fungsional berkorelasi dengan protease homolog manusia, yang menyiratkan Mpro sebagai target mencolok untuk merancang obat.
Beberapa penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa Mpro adalah target utama terhadap infeksi SARS-CoV-2. Namun, alam memberikan obat terbaik. Dalam penelitian sebelumnya, telah ditunjukkan bahwa fitokimia alami mengandung bahan aktif yang mungkin dapat menghambat virus SARS-CoV-2 M pro.
Ficus caricalateks (F-lateks) mencakup molekul penting dengan manfaat luar biasa pada mikroorganisme resisten antimikroba bersama dengan sifat biologis lainnya. F-lateks mengandung asam lemak, flavonoid, fenolat, tanin, alkaloid, terpenoid, dan sterol dengan berbagai manfaat biologis. Telah digunakan sebagai obat tradisional di seluruh dunia dan tidak ditemukan sitotoksisitas pada sel Vero. Beberapa penelitian menemukan bahwa ekstrak buah tin F-lateks memiliki sifat antibakteri, antijamur, dan antivirus.
Senyawa buah tin, F-lateks aktif melawan virus DNA dan RNA termasuk, adenovirus (ADV), echovirus tipe 11 (ECV-11), herpes simpleks tipe 1 (HSV-1), HSV-2, caprine herpesvirus-1 (CpHV-1), human papillomavirus (HPV), dan virus influenza H9N2.
Seperti penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa senyawa F-lateks memiliki aktivitas antivirus potensial terhadap beberapa virus bersama dengan ranah yang sama, riboviria. Sehingga dimungkinkan untuk bertindak melawan SARS-CoV-2.
Skrining virtual mengungkapkan bahwa kandungan buah tin, lupeol, -amyrin, dan luteolin menunjukkan afinitas pengikatan tertinggi dengan protease utama SARS-CoV-2 dan menunjukkan interaksi yang signifikan dan vital dengan residu katalitik His 41 dan Cys 145, atau setidaknya satu dari mereka.
Senyawa yang dipilih juga mewakili interaksi bermakna lainnya. Seperti ikatan hidrogen, ikatan van der Waals, dan ikatan alkil. Studi simulasi dinamika molekuler menggambarkan bahwa di antara semua fitokimia, amyrin adalah fitokimia paling stabil, yang mampu menghambat protease utama SARS-CoV-2 dengan kuat. Selamat mencoba buah tin yaa…… Sampai jumpa di artikel kedokteran islam selanjutnya…
*Dosen Fakultas Kedokteran salah satu PTN di Kota Malang
Penulis buku
1. Muslim Doctor (lambert publishing)
2. Blink Blink Solutions from Prophet Muhammad: To Solve Medical Cases in COVID-19 Era (lambert publishing)
editor: jatmiko
—
Terima kasih sudah membaca artikel kami. Ikuti media sosial kami yakni Instagram @tugumalangid , Facebook Tugu Malang ID ,
Youtube Tugu Malang ID , dan Twitter @tugumalang_id